Repositorio Público
Consulte las investigaciones publicadas e información del repositorio.
Repositorio de Microbiomas
El repositorio de microbiomas del Subcomité de Recursos Genéticos Microbianos e Invertebrados, a través de la colección de Microorganismos del Centro Nacional de Recursos Genéticos (CM-CNRG), brinda un acervo público de microbiomas ambientales de relevancia en el contexto de la alimentación y la agricultura en México. El usuario, podrá consultar, revisar, y depositar archivos de secuencias asociadas al estudio de las comunidades ecológicas de microorganismos comensales, simbióticos y patógenos que comparten en un espacio determinado, primordialmente asociado organismos, ambientes, productos, o derivados de relevancia agroalimentaria; y que podrían ser determinantes de mantener funciones en determinado organismo, potencial productivo, y características o desarrollo de productos agroalimentarios clave para la identidad de su lugar de origen.
Los estudios referenciados en este repositorio pueden abordar aspectos como: integrantes del microbioma, interacciones entre los integrantes de una comunidad de microorganismos, características espaciales y temporales de una determinada comunidad de microorganismos, microbioma núcleo de determinados ambientes, predicción funcional de cierta comunidad de microorganismos, e interacciones huésped-microbioma.
Instrucciones
- El repositorio de microbiomas acepta el registro de archivos de secuencias generados a partir de plataformas de secuenciación de última generación (Illumina, Ion Torrent, Oxford Nanopore, etc.).
- Los archivos deberán comprimirse con gzip o bzip2 únicamente.
- El nombre de cada archivo deberá ser único y no incluir información sensible o confidencial.
- El usuario deberá llenar la tabla de metadatos para los archivos que desee incluir en el repositorio.
- Cada registro podrá contar con uno o varios archivos, en función del tipo de estudio al que se asocie o el tipo de secuenciación utilizado para su generación.
- Para mayor información, por favor contactar a través del apartado Contacto dentro del sitio www.subnargemi.org y uno de nuestros especialistas con gusto le brindará soporte.
Investigaciones Publicadas
| Título del Proyecto | Responsable | Institución | Fecha Liberación | Acciones |
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